EIS Chile cuenta con una muestra probabilística, con distribución no proporcional de los casos a nivel de comunas. Para efectos del muestreo se utilizó el marco muestral del INE (2017). La muestra de la primera ola es de 1.411 casos. El margen de error es de ± 2,7% para las estimaciones sobre el total de la muestra, suponiendo un 95% de confiabilidad y varianza máxima (bajo supuesto de muestreo aleatorio simple). En la segunda ola participaron 551 de los participantes originales.